Podrobně vyšetřuje děti s poruchami výživy, opakovanými bolestmi břicha, nespecifickými záněty střev, chorobami jater, žlučových cest a slinivky. Provádí komplexní ultrazvukové vyšetření a endoskopická vyšetření zažívacího ústrojí včetně extrakcí cizích těles v GIT, endoskopické enterobiopsie., v rámci endoskopického oddělení endoskopickou ultrasonografii, 24 hod.pH metrii, rectální manometrii, ERCP od l0 let věku dítěte.